Sonstige · Lokaler MCP-Server

Cytoscape Desktop MCP

Drive a running Cytoscape Desktop to load, lay out, and style biological networks.

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Was die MCP Registry angibt

Der Eintrag, wie er in der offiziellen MCP Registry veröffentlicht ist (Stand: 4. Oktober 2026), neueste Version.

Registry-Name
io.github.cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge
Version
1.0.3
Status
Aktiv
Kategorie
Sonstige
Transport
stdio (lokaler Prozess)
Paket
MCP Bundle (.mcpb) und npm
Veröffentlicht
11. August 2026
Aktualisiert
11. August 2026
Herausgeber
cytoscape (GitHub)
Namensraum
Namensraum von der MCP Registry über GitHub verifiziert (github.com/cytoscape) · So wird verifiziert
Website
github.com/cytoscape/cytoscape-desktop-mcp
Repository
github.com/cytoscape/cytoscape-desktop-mcp
Quelle
Eintrag in der Registry-API

Pakete

RegistryPaketVersionTransportUmgebungsvariablen
MCP Bundle (.mcpb)https://github.com/cytoscape/cytoscape-desktop-mcp/releases/download/mcpb-v1.0.3/cytoscape-mcp.mcpbSHA-256-Prüfsumme angegeben-stdioCYREST_PORT
npm@cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge1.0.3stdioCYREST_PORT

So verbinden Sie Cytoscape Desktop MCP

Cytoscape Desktop MCP wird lokal ausgeführt, und zwar aus einem MCP Bundle, also einem einzelnen herunterladbaren Archiv mit einem lokalen Server und einem Manifest, das ihn beschreibt: https://github.com/cytoscape/cytoscape-desktop-mcp/releases/download/mcpb-v1.0.3/cytoscape-mcp.mcpb. Der Server spricht MCP über stdio: Der Client startet ihn als Programm und kommuniziert mit ihm über Standardein- und -ausgabe. Benötigt wird ein Client, der MCP Bundles installiert; die Datei wird in diesem Client geöffnet oder ihm hinzugefügt. Der Server liest die Umgebungsvariable CYREST_PORT; legen Sie sie in der Konfiguration des Clients für diesen Server fest.

Cytoscape Desktop MCP wird lokal ausgeführt, und zwar aus einem in der npm-Registry veröffentlichten Node.js-Paket: @cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge, Version 1.0.3. Der Server spricht MCP über stdio: Der Client startet ihn als Programm und kommuniziert mit ihm über Standardein- und -ausgabe. Benötigt wird Node.js; Clients starten das Paket meist mit npx - der übliche Befehl lautet npx -y @cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge@1.0.3. Der Server liest die Umgebungsvariable CYREST_PORT; legen Sie sie in der Konfiguration des Clients für diesen Server fest.

Im JSON-Format mcpServers, das viele MCP-Clients für Desktop und Editor lesen, sieht der Eintrag so aus (Platzhalter in spitzen Klammern):

{
  "mcpServers": {
    "cytoscape-desktop-mcp-bridge": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "@cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge@1.0.3"
      ],
      "env": {
        "CYREST_PORT": "<wert>"
      }
    }
  }
}

Abgeleitet aus dem Registry-Eintrag, hier nicht getestet. Was der Server tut und zu welchen Bedingungen, legt sein Herausgeber fest; prüfen Sie sein Repository oder seine Website, bevor Sie ihm Zugriff auf Ihre Konten oder Dateien geben. So fügen Sie einem Assistenten einen MCP-Server hinzu · Vor dem Verbinden

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