Ontwikkeling · Externe MCP-server

Ensembl MCP Server

Look up genes, sequences, variants, homologs, and cross-database xrefs from Ensembl REST.

Wat de MCP Registry vermeldt

De vermelding zoals gepubliceerd in de officiële MCP Registry (geraadpleegd op 4 oktober 2026), nieuwste versie.

Registernaam
io.github.cyanheads/ensembl-mcp-server
Versie
0.5.0
Status
Actief
Categorie
ontwikkeling
Transport
Streamable HTTP en stdio (lokaal proces)
Pakket
npm
Gepubliceerd
24 september 2026
Bijgewerkt
24 september 2026
Uitgever
cyanheads (GitHub) · 140 servers met een pagina hier
Namespace
Namespace door de MCP Registry geverifieerd via GitHub (github.com/cyanheads) · hoe
Repository
github.com/cyanheads/ensembl-mcp-server
Bron
Vermelding in de register-API

Externe endpoints

TransportURLOpgegeven headers
Streamable HTTPhttps://ensembl.caseyjhand.com/mcpGeen

Livecontrole

Deze directory heeft verbinding gemaakt met elk extern endpoint en om de lijst met tools gevraagd. De controle maakt alleen verbinding en vraagt de tools op; ze voert geen tools uit, logt niet in en test de beveiliging niet.

Bereikbaar
Ja (HTTP 200)
Handshake
ensembl-mcp-server 0.5.0 · protocol 2025-06-18
Gevonden tools
7: ensembl_list_species, ensembl_lookup_gene, ensembl_get_sequence, ensembl_query_region, ensembl_predict_variant, ensembl_get_homology, ensembl_get_xrefs
Gecontroleerd op
5 oktober 2026

Zo werkt de livecontrole

Pakketten

RegisterPakketVersieTransportOmgevingsvariabelen
npmruntime: bun@cyanheads/ensembl-mcp-server0.5.0stdioENSEMBL_BASE_URL en MCP_LOG_LEVEL
npmruntime: bun@cyanheads/ensembl-mcp-server0.5.0HTTPENSEMBL_BASE_URL, MCP_HTTP_HOST, MCP_HTTP_PORT, MCP_HTTP_ENDPOINT_PATH, MCP_AUTH_MODE en MCP_LOG_LEVEL

Zo verbind je Ensembl MCP Server

Ensembl MCP Server is een externe MCP-server: er hoeft niets te worden geïnstalleerd. Het endpoint is https://ensembl.caseyjhand.com/mcp, aangeboden via Streamable HTTP. Voeg in een assistent die externe MCP-servers accepteert (vaak onder een instelling met de naam connectors, integraties of tools) een nieuwe server toe en geef die deze URL; voeg hem in een client die via een bestand wordt geconfigureerd toe als externe (HTTP-)server met dezelfde URL.

De registervermelding geeft geen headers op. Als je voor de server moet inloggen, opent een client die MCP-autorisatie ondersteunt bij de eerste verbinding de eigen inlogpagina van de dienst.

Hij kan ook lokaal draaien vanuit een Node.js-pakket dat in het npm-register is gepubliceerd: @cyanheads/ensembl-mcp-server, versie 0.5.0. Hij spreekt MCP via stdio, dus de client start hem als programma en communiceert ermee via standaardinvoer en -uitvoer. Hij vereist Node.js; clients starten het meestal met npx - het gebruikelijke commando is npx -y @cyanheads/ensembl-mcp-server@0.5.0; de vermelding noemt bun als runtime. Hij leest deze omgevingsvariabelen: ENSEMBL_BASE_URL en MCP_LOG_LEVEL; stel ze in de configuratie van de client voor deze server in.

Hij kan ook lokaal draaien vanuit een Node.js-pakket dat in het npm-register is gepubliceerd: @cyanheads/ensembl-mcp-server, versie 0.5.0. Het pakket start een lokale server die MCP spreekt via Streamable HTTP; de client maakt er vervolgens verbinding mee via een URL (de vermelding noemt bun als runtime). Hij leest deze omgevingsvariabelen: ENSEMBL_BASE_URL, MCP_HTTP_HOST, MCP_HTTP_PORT, MCP_HTTP_ENDPOINT_PATH, MCP_AUTH_MODE en MCP_LOG_LEVEL; stel ze in de configuratie van de client voor deze server in.

In het JSON-formaat mcpServers, dat veel MCP-clients voor desktop en code-editors lezen, ziet de vermelding er zo uit (tijdelijke aanduidingen tussen punthaken):

{
  "mcpServers": {
    "ensembl-mcp-server": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "@cyanheads/ensembl-mcp-server@0.5.0"
      ],
      "env": {
        "ENSEMBL_BASE_URL": "<waarde>",
        "MCP_LOG_LEVEL": "<waarde>"
      }
    }
  }
}

Afgeleid van de registervermelding; de livecontrole hierboven laat alleen zien of het endpoint antwoordde. Wat de server doet en onder welke voorwaarden, bepaalt de uitgever; bekijk de repository of website voordat je de server toegang geeft tot je accounts of bestanden. Een MCP-server aan een assistent toevoegen · Voordat je verbinding maakt

Meer van cyanheads (GitHub)

Alle 140 →
ServerDraaitEndpoint of pakket
Datacite MCP ServerSearch DataCite datasets and software, fetch DOI metadata, trace relations, format citations.Lokaal · stdio en HTTPnpm: @cyanheads/datacite-mcp-server
Devops Status MCP ServerVendor status pages, TLS cert inspection, DNS propagation checks, and incident-response playbooks.Extern en lokaal · HTTP en stdioLivecontrole: ✓ handshakedevops-status.caseyjhand.com
Docgen MCP ServerRender HTML/markdown to PDF, export rows to xlsx, and fill AcroForm PDFs.Lokaal · stdio en HTTPnpm: @cyanheads/docgen-mcp-server
Earthquake MCP ServerSearch USGS and EMSC seismic data - real-time feeds, event queries, and earthquake counts.Extern en lokaal · HTTP en stdioLivecontrole: ✓ handshakeearthquake.caseyjhand.com
Eia Energy MCP ServerBrowse and query the EIA API v2 - electricity, petroleum, natural gas, coal, forecasts via MCP.Extern en lokaal · HTTP en stdioLivecontrole: ✓ handshakeeia-energy.caseyjhand.com
Elevation MCP ServerLook up elevation worldwide, profile route ascent/descent, grid areas, check terrain line of sight.Extern en lokaal · HTTP en stdioLivecontrole: ✓ handshakeelevation.caseyjhand.com
Epa MCP ServerSearch EPA compliance, TRI, Superfund, drinking-water, EJScreen, and AirNow data.Lokaal · stdio en HTTPnpm: @cyanheads/epa-mcp-server
Eur Lex MCP ServerSearch EU legislation, CJEU case law, and treaties; traverse CELLAR graph; browse EuroVoc concepts.Extern en lokaal · HTTP en stdioLivecontrole: ✓ handshakeeur-lex.caseyjhand.com
Eurostat MCP ServerSearch and query the Eurostat catalogue - EU economy, demography, trade, and NUTS regional data.Extern en lokaal · HTTP en stdioLivecontrole: ✓ handshakeeurostat.caseyjhand.com
Evals MCP ServerAuthor verifiable eval records through a draft→review→revise→submit loop with enforced graders.Lokaal · stdio en HTTPnpm: @cyanheads/evals-mcp-server
Exchange Rates MCP ServerConvert currencies, get FX rates, and query historical ECB exchange rate data.Extern en lokaal · HTTP en stdioLivecontrole: ✓ handshakeexchange-rates.caseyjhand.com
Faa Aircraft Registry MCP ServerOffline, keyless lookup of the US civil aircraft registry - decode N-numbers, search records.Extern en lokaal · HTTP en stdioLivecontrole: ✓ handshakefaa-aircraft-registry.caseyjhand.com

Meer servers in de categorie ontwikkeling

Alle 5.152 →
ServerDraaitEndpoint of pakket
Engram: AI memory you can edit in ObsidianShared memory for Claude, ChatGPT and any MCP client. Read and edit it in Obsidian or the web app.Extern · HTTPLivecontrole: inloggen vereistmcp.engram.page
EngraphySelf-hosted MCP memory server: a typed knowledge graph on Postgres 16 and pgvector.Lokaal · HTTPOCI-image (Docker): ghcr.io/devon-clarkk/engraphy:0.3.0
EngrmShared memory across devices, sessions, and agents for OpenClaw, Claude Code, and Codex.Lokaal · stdionpm: engrm
Enigmagent MCPLocal AES-256-GCM vault for AI agents. Secrets stay local, LLMs never see real API keys.Lokaal · stdionpm: enigmagent-mcp
Enterprise MCP GatewayUnified gateway exposing 150+ tools across all NexGenData MCP servers via one endpoint.Extern · HTTPLivecontrole: inloggen vereistnexgendata-mcp-proxy.steve-corbeil.workers.dev
entraadm MCPMCP server for Microsoft Entra ID sign-in and audit-log triage (read-only)Lokaal · stdioPyPI: entraadm-mcp
Env Secret Exposure Analyzer MCPScans projects for secret exposure: leaked API keys, unprotected.env files, and secrets in logs.Lokaal · stdionpm: env-secret-exposure-analyzer-mcp
EnvspeakMCP server and CLI that resolves config/env-var cascade across.env, docker-compose, and Kubernetes.Lokaal · stdionpm: @patrizzos/envspeak