Cytoscape Desktop MCP

Cytoscape Desktop MCP draait lokaal vanuit een MCP Bundle: één downloadbaar archief met een lokale server en een manifest dat die beschrijft: https://github.com/cytoscape/cytoscape-desktop-mcp/releases/download/mcpb-v1.0.3/cytoscape-mcp.mcpb. Hij spreekt MCP via stdio, dus de client start hem als programma en communiceert ermee via standaardinvoer en -uitvoer. Hij vereist een client die MCP Bundles installeert; het bestand wordt in die client geopend of eraan toegevoegd. Hij leest de omgevingsvariabele CYREST_PORT; stel die in de configuratie van de client voor deze server in.

Cytoscape Desktop MCP draait lokaal vanuit een Node.js-pakket dat in het npm-register is gepubliceerd: @cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge, versie 1.0.3. Hij spreekt MCP via stdio, dus de client start hem als programma en communiceert ermee via standaardinvoer en -uitvoer. Hij vereist Node.js; clients starten het meestal met npx - het gebruikelijke commando is npx -y @cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge@1.0.3. Hij leest de omgevingsvariabele CYREST_PORT; stel die in de configuratie van de client voor deze server in.

In het JSON-formaat mcpServers, dat veel MCP-clients voor desktop en code-editors lezen, ziet de vermelding er zo uit (tijdelijke aanduidingen tussen punthaken):

{
  "mcpServers": {
    "cytoscape-desktop-mcp-bridge": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "@cytoscape/cytoscape-desktop-mcp-bridge@1.0.3"
      ],
      "env": {
        "CYREST_PORT": "<waarde>"
      }
    }
  }
}

Afgeleid van de registervermelding, hier niet getest. Wat de server doet en onder welke voorwaarden, bepaalt de uitgever; bekijk de repository of website voordat je de server toegang geeft tot je accounts of bestanden. Een MCP-server aan een assistent toevoegen · Voordat je verbinding maakt