Overig · Lokale MCP-server
phylokit-mcp
Phylogenetic inference via IQ-TREE 3 - never returns a topology without its support.
Wat de MCP Registry vermeldt
De vermelding zoals gepubliceerd in de officiële MCP Registry (geraadpleegd op 4 oktober 2026), nieuwste versie.
- Registernaam
io.github.musharna/phylokit-mcp- Versie
- 0.6.0
- Status
- Actief
- Categorie
- overig
- Transport
- stdio (lokaal proces)
- Pakket
- PyPI
- Gepubliceerd
- 26 september 2026
- Bijgewerkt
- 26 september 2026
- Uitgever
- musharna (GitHub) · 8 servers met een pagina hier
- Namespace
- Namespace door de MCP Registry geverifieerd via GitHub (github.com/musharna) · hoe
- Website
- github.com/musharna/phylokit-mcp
- Repository
- github.com/musharna/phylokit-mcp
- Bron
- Vermelding in de register-API
Pakketten
| Register | Pakket | Versie | Transport |
|---|---|---|---|
| PyPIruntime: uvx | phylokit-mcp | 0.6.0 | stdio |
Zo verbind je phylokit-mcp
phylokit-mcp draait lokaal vanuit een Python-pakket dat op PyPI is gepubliceerd: phylokit-mcp, versie 0.6.0. Hij spreekt MCP via stdio, dus de client start hem als programma en communiceert ermee via standaardinvoer en -uitvoer. Hij vereist Python; clients starten het meestal met uvx (uit uv) of na pip install - het gebruikelijke commando is uvx phylokit-mcp. Hij leest deze omgevingsvariabelen: OMP_NUM_THREADS en MKL_NUM_THREADS; stel ze in de configuratie van de client voor deze server in.
In het JSON-formaat mcpServers, dat veel MCP-clients voor desktop en code-editors lezen, ziet de vermelding er zo uit (tijdelijke aanduidingen tussen punthaken):
{
"mcpServers": {
"phylokit-mcp": {
"command": "uvx",
"args": [
"phylokit-mcp"
],
"env": {
"OMP_NUM_THREADS": "<waarde>",
"MKL_NUM_THREADS": "<waarde>"
}
}
}
}Afgeleid van de registervermelding, hier niet getest. Wat de server doet en onder welke voorwaarden, bepaalt de uitgever; bekijk de repository of website voordat je de server toegang geeft tot je accounts of bestanden. Een MCP-server aan een assistent toevoegen · Voordat je verbinding maakt
Meer van musharna (GitHub)
| Server | Draait |
|---|---|
| breedsim-mcpBreeding-scheme simulation via AlphaSimR. Needs R, AlphaSimR and libtirpc-dev on the host. | Lokaal · stdio |
| Data AggregatorFind & fetch research datasets across 17 archives, omics registries, and literature sources. | Lokaal · stdio |
| jobdSelf-hostable GPU-aware job broker: submit, route by VRAM, babysit jobs across machines via MCP. | Lokaal · stdio |
| ldraw-mcpRender LDraw/LEGO models to images with real part geometry via headless Blender + ImportLDraw. | Lokaal · stdio |
| Plant GenomicsPlant genomics MCP - 56 tools across 23 backends with cross-source synthesis. | Lokaal · stdio |
| plantcv-mcpPlant phenotyping via PlantCV - returns traits plus the segmentation overlay they came from. | Lokaal · stdio |
| tmodloader-mcpDrive a running tModLoader (Terraria) instance from an agent: launch, query, screenshot, read state. | Lokaal · stdio |
Meer servers in de categorie overig
| Server | Draait |
|---|---|
| Photoshop MCPMCP server for Adobe Photoshop - 127 tools (generative AI + recipes), standalone web UI. Control Ph… | Lokaal · stdio |
| Phrase FlipPrivacy-first local phrase-flipped translation for AI chat clients. | Lokaal · stdio |
| Phrase MCPPhrase MCP server: language intelligence platform for translation, terminology, and quality. | Extern · HTTPLivecontrole: inloggen vereist |
| PhyllUX review for apps built with AI, run by your own agent. The fixes keep your design. | Lokaal · stdio |
| Physician ReviewPhysicians for the agentic era. Book a US-licensed doctor: orders, prescribes, 90-day plan. | Extern · HTTPLivecontrole: ✓ handshake |
| Pi-hole MCP ServerMCP server for Pi-hole v6 API - manage multiple instances: queries, lists, groups, stats. | Lokaal · stdio |
| Piaso MCPPIASO single-cell ecosystem docs (PIASO, COSG, cytome, LARIS, cytorete) + live PIASOmarkerDB. | Lokaal · stdio |
| Piazza in FestaSagre, feste e manifestazioni dei comuni italiani, ricavate ogni giorno dagli albi pretori. | Extern · HTTPLivecontrole: ✓ handshake |