BioMCP-TS

BioMCP-TS רץ באופן מקומי מתוך חבילת Node.js שפורסמה במרשם npm: biomcp, גרסה 1.4.3. הוא משתמש ב-MCP על גבי stdio, ולכן הלקוח מפעיל אותו כתוכנה ומתקשר איתו דרך קלט ופלט סטנדרטיים. כדי להריץ אותו צריך Node.js; לקוחות מפעילים אותו בדרך כלל עם npx - הפקודה המקובלת היא npx -y biomcp@1.4.3. הוא קורא את משתני הסביבה האלה: ANALYSIS_BIOWASM, ANALYSIS_R, DB_TYPE, NCBI_API_KEY (סודי), S2_API_KEY (סודי), OPENFDA_API_KEY (סודי), ONCOKB_TOKEN (סודי) ו-DISGENET_API_KEY (סודי); יש להגדיר אותם בתצורת הלקוח עבור השרת הזה.

בפורמט ה-JSON של mcpServers, שלקוחות MCP רבים לדסקטופ ולעורכי קוד קוראים, הרשומה נראית כך (מצייני מקום בסוגריים זוויתיים):

{
  "mcpServers": {
    "biomcp-ts": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "biomcp@1.4.3"
      ],
      "env": {
        "ANALYSIS_BIOWASM": "<ערך>",
        "ANALYSIS_R": "<ערך>",
        "DB_TYPE": "<ערך>",
        "NCBI_API_KEY": "<סוד>",
        "S2_API_KEY": "<סוד>",
        "OPENFDA_API_KEY": "<סוד>",
        "ONCOKB_TOKEN": "<סוד>",
        "DISGENET_API_KEY": "<סוד>"
      }
    }
  }
}

נגזר מהרשומה במרשם, ולא נבדק כאן. מה השרת עושה, ובאילו תנאים, נקבע על ידי המפרסם שלו; כדאי לבדוק את מאגר הקוד או את האתר שלו לפני שנותנים לו גישה לחשבונות או לקבצים שלך. איך מוסיפים שרת MCP לעוזר AI · לפני שמתחברים